Dünya, 1982 yılında beklenmedik bir ziyaretçiye kapılarını açar. Uzayın sonsuz derinliklerinde süren yolculuklarının sonunda, son bir grup uzaylı nihayet yeryüzüne iniş yapar. Güney Afrika’nın sakin ve tenha bir bölgesine yerleşen bu varlıklar, insanlıktan uzak bir hayat sürmeyi umarlar. Ancak MNU adında güçlü bir şirket, bu uzaylıların varlığını fark eder ve hemen harekete geçer. Şirket, bu yabancıların sahip olduğu ileri teknolojiyi ele geçirip büyük bir bilimsel atılım yapma peşindedir. Bunun için uzaylıları District 9 adını verdikleri bir bölgeye hapsederler. Şirketin planları, MNU’nun sıradan bir çalışanı olan Wikus van der Merwe’nin beklenmedik bir şekilde bir virüse maruz kalmasıyla altüst olur. Virüs, Merwe’nin DNA’sını etkileyerek onu yavaş yavaş bir uzaylıya dönüştürmeye başlar. Merwe, bu dönüşüm sırasında hem insanlardan hem de uzaylılardan kaçmak zorunda kalır. District 9’a sığınan Merwe, burada kendi varlığını korumaya çalışırken, aynı zamanda insanların ve uzaylıların kaderini değiştirecek bir lider haline gelir. Onun mücadelesi, sadece kendi hayatını değil, iki dünya arasındaki dengeyi de koruma çabasıdır.