17 yaşındaki suikastçı Codename 13, hayatının karmaşık ipuçlarını çözmeye yönelik bir yolculuğa çıkar. Ölümcül sanatında büyük bir ustalık kazanan 13, Gölge adlı gizli suikast kolektifinin en değerli elemanıdır. Ancak, Japonya’da gerçekleştirdiği bir görevde yaptığı bir hata, onu akıl hocası Umbra’dan uzaklaştırarak Endonezya’nın Cakarta şehrine sürgün edilmesine neden olur. Cakarta’nın tehlikelerle dolu sokaklarında saklanırken, 11 yaşındaki Monji ile tanışır. Monji, annesini acımasız bir suç örgütü tarafından kaçırılmış bir çocuk olarak yaşam mücadelesi vermektedir. Monji’nin hikayesi, 13’ün içinde bastırılmış vicdanını uyandırır ve zamanla aralarında güçlü bir bağ oluşur. Ancak, Monji bir gün aniden kaybolduğunda, 13, onu kurtarmak için harekete geçmeye karar verir. Bu karar, yalnızca suç örgütlerine karşı bir savaş açmakla kalmayıp, aynı zamanda Gölge’ye ve akıl hocası Umbra’ya karşı bir isyan anlamına gelir. 13, Cakarta’nın yeraltı dünyasında karşılaşacağı düşmanlarla cesurca yüzleşmeye kararlıdır. Kendi karanlık geçmişiyle yüzleşirken, Monji’yi kurtarmak için her türlü riski alacak ve bu yolculuk, onun için sadece bir kurtuluş değil, aynı zamanda kendini bulma süreci olacaktır. Monji’nin hayatını kurtarmak uğruna her şeyi riske atarak, karanlık dünyalarda yeni bir mücadeleye girişecektir.